粗略来看，X-E3仍然延续了富士X系列无反复古的机身外观设计，仔细把玩之下才会发现，X-E3比起前代X-E2/X-E2s来说，外观方面有了非常显著的风格变化，而尺寸体积也有明显的变化。X-E3更为简洁，机身的线条更加有设计感，抛弃了许多设计上的杂乱和凸起，但是并没有降低操控和手感。
首先，要提到一点，X-E3取消了内置弹出式闪光灯，但随机附带了一支小巧的折叠闪光灯EF-X8。闪光灯的质感处理的也比较到细腻，漆面和X-E3的漆面保持了一致。
正面来看，最明显的变化就是在保证右手握持手感不变的情况下，X-E3的机身宽度比X-E2s减少了7.7mm，横向减少了7.7mm让X-E3一下子看起来紧凑许多。并且通过将厚度增加5.5mm以及将镜头位置向机身左侧偏移，保留了足够的握持空间，并且手感还更为紧致，没有因为缩减尺寸而导致握持困难。
