三向翻转屏
前文谈到，这款相机配备了3.2英寸236万点液晶屏，覆盖率为100%。该屏幕支持触摸功能，允许直观操作，例如选择菜单和自动对焦点、放大和缩小图像、进一步构图等。此外，该三向翻转屏，能够在水平风景拍摄时向上或向下翻折，或者在竖拍时向上翻折（90°向上、45°向下和60°向右），从而方便从高、低角度取景和拍摄。
在机身背面左侧主要由显示屏占据，而右侧则是重要操控区域，从上至下，最上方是Fn4功能按钮、后指令波轮、Fn3功能按钮并排，操作过程中拇指波动后指令波轮会时常碰到背部凸起。往下对焦摇杆和Q(快速菜单)按钮一排，Fn5功能按钮则处于十字选择键之上，最下方则是DISP（显示）按钮。总的来说该区域的按键分布与X-T系列有些类似，对富士老用户来说上手并不困难。
侧面接口
GFX 50S的主要接口集中在相机一侧，接口种类比较丰富，包括用于连接电脑拍摄的USB 3.0、用于将图像输出至外部显示器的HDMI Micro接口、遥控快门释放端口、麦克风输入和耳机插孔。 将可选的交流电源适配器AC-15V连接至直流输入端口，以此可使用外部电源运行和为相机充电。
侧面有电池仓
供电方面，这款相机电池仓设计非常特别，并不在常见的手柄底部，而是在相机侧面，这也是这款相机背部加厚的原因。这样设计的好处在于机身电池仓与手柄电池仓可独立使用。GFX 50S标配一块NP-T125锂离子电池，由于采用大尺寸传感器和大尺寸焦平面快门而增加的能耗，NP-T125为高容量电池，使用单节电池可以拍摄大约400张照片（开启自动节电功能）。 实际使用来说这款中画幅相机的续航还算可以，与全画幅单反相比仍有差距。当然作为专业机，该相机可以另购竖拍电池手柄VG-GFX1，延长续航提升竖拍手感。
双SD存储卡仓
存储方面，GFX 50S与X系列相同，采用SD卡（兼容UHS-II）作为存储介质。相机配备双插槽，可支持三种不同类型的记录方法，即“依次”：可以根据拍摄顺序持续记录；“备份”：同时在两张卡上记录相同数据；“排序分类”：在不同的SD卡上分别记录RAW和JPEG数据。
