为了实现小巧的机身设计,X-M1取消了独立的快门和曝光补偿转盘。不过提供了双指令拨盘,用户可以使用其进行直接快速的操作。主指令转盘位于机身顶部的右侧,另一个是位于机身背面的立式设计指令拨盘。主指令转盘可在半自动、自动模式拍摄时实现调整曝光补偿的功能;而在全手动模式下,则用于设置快门速度。立式指令拨盘则可以调整光圈范围。此外,模式转盘也设置在机身顶部右侧,因此使用右手手指即可操作,简单而直接。
X-M1虽然没有配置电子取景器,但采用了92万像素3.0英寸可翻转式LCD显示屏。显示屏能够向上或向下约90度倾斜。本机是富士首款搭载翻转屏的X系列无反相机。