一张不行，多拍几张
显微摄影是科学摄影的一种，它的拍摄策略与普通摄影不同，甚至与微距摄影也有很多迥异之处。很多显微摄影作品不单单只靠一张照片拍出来的，有可能是多张照片的联合。比如，有些亮度很低的目标，需要的曝光时间很长，带来了大量噪点，画质受到了很大损失，因此采用多张连续拍摄，叠加降噪的方式可以大大提高画质，类似的方法还有暗场扣除法等。
Canon EOS 750D 快门：1/3 ISO：200 马齿苋的种子
显微摄影由于倍数高，拍摄照片的景深很小，即便收缩光阑，景深的增大也很有限，反而由于衍射定律的限制，降低了图像的分辨率。因此对于大景深拍摄，多采用焦点堆叠技术，也就是从上至下依次拍摄，后期通过软件，将清晰的部分叠合起来，形成一张全景深图片。这些技术都是在普通摄影中极少用到的。
光线变化，超乎想象
另外，显微摄影的光线运用也比普通摄影复杂很多，明堂五花八门。比如暗场效果的拍摄，使用专用的暗场聚光镜，利用丁达尔散射效应，可以拍出背景漆黑，主体明亮的效果，而且分辨率比一般的显微拍摄还要高。偏振光拍摄是专门拍摄晶体的一门技术，利用两枚偏振片正交，这样就将拍摄晶体的折射特性凸显出来，营造出五彩缤纷的色彩。对于摄影者，会体会到这种神奇的效果，对于研究者，可以利用这些颜色从事分析工作。
Canon EOS 750D 光圈：F1 快门：1/3 ISO：200 蜂蜜
高倍的显微摄影存在着高分辨与高反差不能兼得的问题，利用光线的技术，可以达到分辨率和反差相对双高的效果。常见的有相差、霍夫曼干涉、微分干涉等方法，其中相差法利用环形的结构实现较低分辨率的高反差，拍摄物体的边缘极为分明，而且能将透明物体内部的模糊影像清晰呈现。微分干涉是在较高分辨率部分实现高反差，拍摄出来的物体有立体浮雕效果，细节变得更为显著。
Canon EOS 750D 快门：1/10 ISO：400
而普通摄影中的一些光线运用，也可以在显微摄影中得到体现，比如斜射光照明、多色照明，特别是柔光技术运用在显微摄影中后，可以将高反光物体的细节展示清晰，正因为这些技术的应用，让显微摄影的效果不断刷新，达到一个又一个新的高度。
而显微摄影的乐趣也正在于——将眼前所见的普通世界，在神奇的镜头与繁复的拍摄技法下，呈现出独一无二、令人惊叹且充满变化的另一幅奇幻景象。
