也是在SB-80DX推出的用户设定功能在SB-800被扩展，包括设定遥控主副灯等控制。用户设定中还有一些有意思的项目，如关闭闪光功能，把SB-800当成对焦辅助灯等。
SB-800的辅助对焦灯比以前重大改进，从单灯改为双灯。而且辅助灯打出的图纹从原来的几条直线改为一个非常清晰的多线十字，覆盖范围也比以前增加了很多。
防红眼的灯被取消，用普通闪光灯自己多次闪光来得到防红眼效果。
接下来介绍CLS的几个功能。先介绍Auto FP。FP（焦平面）闪光是一个高速闪光模式，它的功能是让相机使用超过同步闪光速度进行闪光。
我们都知道机械焦平面快门相机都有一个最高闪光同步速度，这个速度是由快门缝在焦平面移动速度所决定。如果快门速度快于这个同步速度时闪光灯无法在覆盖整个胶片/感光器。通常单反相机最高闪光同步速度在1/125到1/500。
那么如何在某些场合需要使用同步速度高于同步速度？如在白天光线强烈需要用闪光灯用比如1/2000快门速度。
在一些高级相机如尼康的F5、F100、F90，以及D1系列上支持FP闪光。这由闪光灯在快门移动过程中连续发出多次闪光以覆盖整个曝光面积。当然FP闪光有其代价：有效闪光距离减少，通常只有三分之一。
在SB-800和D2H之前FP闪光需要使用手动曝光模式，这个设定过程比较复杂（我没有用过，抄书）：
1）相机选用手动曝光模式
2）闪光灯选用手动模式
3）在闪光灯手动模式中再选用FP模式
4）根据拍摄距离计算光圈和闪光输出
5）在相机上设定光圈和快门速度
自动FP把这个过程完全简化，只需要在相机（D2H）上启动FP模式（用户设定e1），然后只要相机的快门速度超过最高同步速度（D2H是1/250）闪光灯就自动进入FP闪光模式，对用户是完全透明，只需要注意闪光灯覆盖距离而已。
不过遗憾的是在增加了自动高速闪光功能后，SB-800不再支持原来的手动FP模式。
