3.F8光圈AF支持
1DX支持F8
D5支持F8
需要注意的是EOS-1D X Mark II这次是61点全都支持最大光圈F8的自动对焦，使用增倍镜时也能实现最多21点的十字型自动对焦！要知道支持F8光圈是佳能相对尼康的短板，上代EOS-1D X固件升级后仅中央1点（扩展自动对焦区域时5点自动对焦）支持，如今可谓大大提升成功逆袭尼康（D5有15点支持f/8，其中9个可选）。在生态摄影中，一些需要增倍镜拍摄野生动物时，佳能的对焦系统可选余地更多，可以说尼康一直强调性能现在反倒成为佳能手中的利器。不过该功能对于其他题材用处并不大，而且D5也并非弱到仅有中心点可用。
4.暗处对焦能力
佳能在F8光圈支持上扳回一城，但在暗处的自动对焦能力上又输给了尼康，EOS-1D X Mark II仅有中央自动对焦点达到-3EV，而尼康D5的Multi-CAM 20000自动对焦传感器模块，所有AF点可在-3 EV时实现对焦，中央对焦点在-4 EV时实现对焦。两者差距绝非依靠闪光灯（对焦辅助）能够解决的，从数据上看尼康的暗部对焦要比F8支持更为实用，然而这只是厂商标称上-3EV和-4EV的差别，实际对焦能力还需真机对比。
5.对焦区域和算法
EOS-1D X Mark II配备了7种自动对焦区域选择模式。可根据被摄体情况区分使用。其中，新配备的大区域自动对焦适合用于想要兼顾构图与快门时机的情况，可以搭配单次自动对焦或人工智能伺服自动对焦使用。AF算法方面，EOS-1D X Mark II配备了以新算法对动态被摄体进行预测和控制的人工智能伺服自动对焦III+。
