佳能EOS M6 Mark II机身左侧，MIC接口和遥控接口，以及内置闪光灯弹起按键
佳能EOS M6 Mark II机身右侧，HDMI接口和USB Type-C接口
支持通过选购的USB电源适配器PD-E1，连接相机的USB Type-C接口直接为相机进行充电
电池和SD存储卡从底部装入，电池依然采用LP-E17（1040mAh）
EOS M6 Mark II导入了触摸和拖拽自动对焦，当搭配外接电子取景器时，可通过液晶监视器上的触摸操作来控制取景器中显示的自动对焦框。由此观察取景器的同时，手指在液晶监视器上滑动就可便捷地移动自动对焦框。
