机身背面的材质和前两代产品一样，光滑的金属外壳比较容易划伤，用户在使用的时候最好配上硅胶外套。新nano的HOLD键设计在了机身底部，和数据线接口、耳机接口排列在一起，但是由于机身过小，机身正面几乎没有可下手拿着的地方，HOLD键又设计在底部的角落里，所以操作起来有些不顺手，需要像变扑克牌魔术那样用两个手指夹住机身的边缘，然后再用大拇指进行操作，这种方式如果操作熟练了使用起来也很顺手。
新nano的菜单设计有了很大改观。首先，它采用了左右分栏的显示方式，左边显示菜单栏，而右边则显示相应菜单选项的内容，如果是音乐或者电影菜单选项，右边就会自动显示相关的专辑封面、影片截屏或海报，这些画面在用户通过iTunes同步音乐或影片的时候iTunes会自动从网上下载相关图片。
在音乐菜单下，新nano也融合了iPhone的Cover Flow功能界面，在选择音乐专辑的时候，专辑会按照顺序横向排列，这时候滑动Scrollwheel键盘，专辑就会顺序排列显示，选择好想要播放的专辑后按下中间的确定键就可以选择，再次按下确定键就开始播放了。这一功能使用起来非常方便，不过由于Scrollwheel键盘的灵敏度比较高，刚开始操作会有些不习惯，这个问题在调节音量的时候也会体现出来。
