变化最大是机身后背。可用于浏览图片和设定众多的参数的1.8英寸大11万8千象素TFT彩色液晶显示屏位于机身后背正中央。这个位置解决了D1系列位于后背左侧显示屏容易被鼻子弄脏的问题。此外与D1系列的半通明LCD罩不同，D100使用了一块通明的塑料液晶保护罩以保护显示屏，在拍摄中保护罩完全不要取下。D100的LCD显示屏比D1系列的明亮很多，在白天也可以有效地使用。
胶片相机上的十字焦点选择器(多重选择器)被兼用于菜单导向和选择。原来的机械锁定被改为一个独立电子开关。
位于液晶显示屏左方有五个按钮：显示器，MENU(菜单)，图象浏览，图象保护锁，和ENTER(确认)。显示屏右下方有一个删除按钮。拍摄完成后按显示器可以马上显示刚拍摄的图片，使用其他按钮可以执行各种浏览功能。
在后背的右方藏有Compact Flash(CF)插槽。与专业D1系列不同，CF卡插槽盖没有保险机构，只需要掀开一小盖和按一小键就可以取出CF卡。为了节省空间D100的CF卡槽是稍带角度。D100支持CF I型和CF II型，包括大容量的微硬盘(Microdrive)。
机身侧面有一橡胶盖，里面藏有视频输出接口和电脑接口(USB 1.1)。用随机包装的电缆可将相机连接到视频设备如电视机或录像机。 直流电源接口机身前方，在固定场合长时间使用相机时可使用交流电源稳压器(需另外购买)。
D100系列与Nikon出产的SB系列闪光灯相配，但需要使用新出品的SB-28DX，SB-50DX或SB-80DX才能有D-TTL功能。最高快门同步速度为1/180秒。
随机包装的还有D100说明书，用于浏览和拷贝相片的Nikon View 5软件光盘，视频电缆，相机背带，快速充电器和EN-EL3 1400mAh锂(Li)电池。
